省部级科研平台
教育部重点实验室
- 水动力学教育部重点实验室（B）
- 海洋智能装备与系统教育部重点实验室（B）
- 动力机械与工程教育部重点实验室
- 未来媒体网络协同创新中心
- 电力传输与功率变换控制教育部重点实验室
- 系统控制与信息处理教育部重点实验室
- 高速电路系统与电磁兼容研究教育部重点实验室（B）
- “智能计算与智能系统”教育部-微软重点实验室（筹）
- 科学工程计算教育部重点实验室
- 人工结构及量子调控教育部重点实验室
- 粒子物理与星系宇宙学教育部重点实验室
- 激光等离子体教育部重点实验室（B）
- 遗传发育与精神神经疾病教育部重点实验室
- 系统生物医学教育部重点实验室
- 细胞分化与凋亡教育部重点实验室
- 环境与儿童健康教育部重点实验室
教育部国际合作联合实验室
科技部国合实验室-上海交大
- 上海交通大学激光制造国际科技合作基地-示范型国际合作联合基地
- 系统生物医学国家级国际联合研究中心-国家级国际联合研究中心
- 先进核能系统热工水力基础研究国际科技合作基地-2013年示范型国际合作联合基地
- 多尺度复合材料国际联合研究中心
- 上海转化医学国际联合研究中心
卫生部重点实验室
农业部重点实验室
教育部工程研究中心
上海市重点实验室
- 上海市胃肿瘤重点实验室
- 上海市骨科内植物重点实验室
- 上海市糖尿病重点实验室
- 上海市激光制造与材料改性重点实验室
- 上海市胰腺疾病重点实验室
- 上海市网络化制造与企业信息化重点实验室
- 上海市数字媒体处理与传输重点实验室
- 上海市内分泌肿瘤重点实验室
- 上海市环境与儿童健康重点实验室
- 上海市电气绝缘与热老化重点实验室
- 上海市口腔医学重点实验室
- 上海市信息安全综合管理技术研究重点实验室（联合格尔）
- 上海市血管生物学重点实验室
- 上海市眼底病重点实验室
- 上海市组织工程研究重点实验室
- 上海市生殖医学重点实验室
- 上海市人类基因组研究重点实验室
- 上海市兽医生物技术重点实验室
- 上海市胚胎与生殖工程重点实验室
- 上海市重性精神病重点实验室
- 上海市复杂薄板结构数字化制造重点实验室
- 上海市可扩展计算与系统重点实验室 （省部共建国家培育基地）
- 上海市北斗导航与位置服务重点实验室
- 上海市先进高温材料及其精密成形重点实验室
- 上海市粒子物理宇宙学重点实验室
- 上海市肿瘤微环境与炎症重点实验室
- 上海市妇科肿瘤重点实验室
- 上海市辅助生殖与优生重点实验室
- 上海市小儿消化与营养重点实验室
- 上海市耳鼻疾病转化医学重点实验室（筹）
- 上海市中西医结合防治骨与关节病损伤重点实验室
- 上海市公共建筑和基础设施数字化运维重点实验室
- 上海市手性药物分子工程重点实验室